[ocrack 原创]bioperl 迁移到GitHub中了

来源:互联网 时间:1970-01-01

Bioperl wiki原文链接如下:
http://www.bioperl.org/wiki/Using_Git

我的乖乖,太棒了!

有了这家伙,烦人的模块更新应该就可以解决了。
操作如下:
1,首先安装工具git,不多表(./configure,make,make install)
2,从GitHub下载bioperl-live
创建git存放的文件夹,切换,然后

$ git clone git://github.com/bioperl/bioperl-live.git

运行完成后会在新建文件夹 bioperl-live,ok!bioperl-live 安装完毕,不过还有一个步骤,这个步骤告诉perl到那里寻找我们安装的模块的位置。

$ export PERL5LIB="$HOME/git/bioperl-live:$PERL5LIB"

运行

$ perl -MBio::Perl -le 'print Bio::Perl->VERSION;'

打印如下:

1.0069


未安装是显示的是
1.006001

大功告成!
ps:我用的是zsh,其他的具体的操作见bioperl wiki 链接。
ps2:要想一直使用live版的bioperl 可将上面的环境变量设置语句放置在对应的shell控制文件中,比如我的zsh控制文件安是~.zshrc(感觉自己太唐僧了,嘿嘿)。


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