redhat之数据挖掘R语言软件及rstudio-server服务的安装

来源:互联网 时间:1970-01-01

  • 安装时间:2015年8月25日 22:55:35
  • 作者:luomg
  • 软件:R、Rstudio-server
  • 环境:redhat6.2
  • 联系[email protected]
  • 声明:如果你有遇到安装中的问题欢迎跟帖交流

 

        今日倒腾了一下午终于搞定了R环境的安装,R由于调用了很多fortran库,安装略显麻烦,提供安装脚本之前先来个hell word

 

        *如下为安装脚本,可以直接复制执行,也可以写成脚本

 1 yum install *fortran* texinfo g++   glibc* gcc-c++   readline* libXt-devel   java* -y

2 #wget http://ftp.iitm.ac.in/cran/src/base/R-3/R-3.2.2.tar.gz

8

9 curl -O http://ftp.iitm.ac.in/cran/src/base/R-3/R-3.2.2.tar.gz

10 tar -zxf R-3.2.2.tar.gz

11 cd R-3.2.2

12 ./configure --enable-R-shlib --enable-R-static-lib --enable-BLAS-shlib --enable-static=yes --enable-shared=yes

13 make CFLAGS=-fPIC

14 make install

15 cp lib/libR* /usr/local/lib64/R/lib/

16

17 curl -O https://download2.rstudio.org/rstudio-server-rhel-0.99.484-x86_64.rpm
18 rpm -ivh rstudio-server-rhel-0.99.484-x86_64.rpm
19 rstudio-server verify-installation

20 iptables -A INPUT -p tcp -dport 8787 -j ACCEPT

21 netstat -antl

 

安装常见问题

1、无法安装pdf

/usr/bin/install: 无法获取"NEWS.pdf" 的文件状态(stat): 没有那个文件或目录
/usr/bin/install: 无法获取"NEWS.pdf" 的文件状态(stat): 没有那个文件或目录
make: *** [install-sources2] 错误 1

解决办法:这个问题是由于服务器最小化安装导致不能整上pdf的doc帮助,所以去掉即可

vim  doc/Makefile

将18、19行改为下面这样,即去掉NEWS.pdf

INSTFILES2 = NEWS.rds NEWS
NON_SVN_INSTFILES = FAQ RESOURCES NEWS

 INSTFILES2 = NEWS.rds NEWS
 19 #NEWS.pdf
 20 NON_SVN_INSTFILES = FAQ RESOURCES NEWS
 21 #NEWS.pdf
 22 ## generated later.

【更新】

  • 2015年9月15日 13:18:42 rstudio-server执行plot函数报错
  • > plot(data$VALUE)

    Error in RStudioGD() :

    Shadow graphics device error: r error 4 (R code execution error)

    此外: Warning message:

    In grDevices:::png("/tmp/RtmpcMXZp5/661bb3eb614046e699ef8e2416bbf4b8.png", :

    本R版本不支持png

     

    >

    1


     



    解答:执行函数capabilities()观察支持情况

  • 2015年9月12日 23:57:10 如果发现verify没有问题,但是还是访问不了,这个时候需要查看防火墙设置
  • 2015年9月11日 17:39:51  更新下载命令,将代码作为bash插入,方便复制
  • 2015年9月11日 16:18:45  更新安装基础文件
  • 2015年8月25日 23:28:33  增加对安装pdf失败的补充

 


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